El jugador puede escoger entre los dos nuevos detectives que acaban de ser asignados a la División 1 del Departamento de Investigación Criminal; NadeshikoKugatachi, un calmado y serio inspector que ha perdido la memoria, y TakumaTsurugi, un Ejecutor lanzado que está buscando a su amigo de la infancia desaparecido.
Deberás decidir el mejor camino a tomar para cada situación, pero independientemente de la jerarquía que separa a Inspectores y Ejecutores, los jugadores tendrán que tener en cuenta que cada decisión tiene sus propias consecuencias. Con un intrincado sistema de toma de decisiones, PSYCHO-PASS: MandatoryHappinessofrece una trama retorcida y casos convincentes, proporcionando un buen número de finales diferentes.
En última instancia, dependiendo de las decisiones tomadas, los Huepueden deteriorarse hasta tal punto que no se puedan recuperar, y los casos pueden quedar sin resolver, haciendo que el juego termine antes de lo previsto.