En juegos anteriores se podían descubrir ciertos Pokémon solo en una de las versiones, y esto se mantiene en
Sol y Luna, que tendrán Pokémon exclusivos (destacando los legendarios Lunala y Solgaleo). A esta peculiaridad se suma ahora la diferencia horaria establecida entre ambos juegos. Los dos mundos de Pokémon Sol y Pokémon Luna están ligados a la hora real, pero con medio día de diferencia.
- Pokémon Sol está sincronizado con la hora de la consola Nintendo 3DS
- Pokémon Luna cuenta con una variación de 12 horas.
Esto afectará evidentemente al desarrollo de la aventura. Los jugadores se toparán con Pokémon distintos en la misma ruta, dependiendo de si es de día o de noche, con lo que su experiencia también cambiará en función de la versión elegida.
Algunos de los Pokémon dominantes que aparecen en las pruebas a lo largo del juego también diferirán según la versión.