Estamos en el mundo subterráneo de Felicidad, así en español y tal como suena, un lugar en el que como no puede ser de otra forma conviven personas y toda clase de monstruos en perfecta armonía. Los personajes que dan nombre al juego, Farmagia, son agricultores que crían y comandan monstruos en una sociedad que prospera gracias a estos, al Magus Diluculum, y los generales del Magus conocidos como Oración Seis. Sin embargo, tras la muerte del Magus, el general Glaza toma el poder y oprime a los habitantes, por lo que le toca al jugador ponerse en el papel del protagonista, Ten, que junto con otros Farmagia deberán luchar para liberar a Felicidad del régimen tiránico de Glaza. Su historia de rebelión y amistad impulsa su narrativa, no solo mediante los combates, la exploración y la crianza de criaturas, sino también mediante la interacción social con otros personajes y espíritus elementales para desbloquear monstruos y transformaciones definitivas.
Con este planteamiento, Marvelous nos presenta una experiencia de juego que mezcla la acción de combate con la gestión de recursos y la crianza de monstruos, con lo que vamos a encontrar con una ligera diferencia con otros juegos de corte similar como son juegos de la saga Harvest Moon, específicamente de cuidar granja, o títulos como HARVESTELLA, en el que tendremos cierta parte también de rol de acción incluida. En Farmagia debemos cultivar y entrenar monstruos en nuestra granja, comandar un ejército de criaturas en batallas, explorar las tierras peligrosas de Felicidad, luchar contra jefes o recolectar recursos para mejorar habilidades y desarrollar nuevas características de los monstruos. La mezcla es más curiosa y orienta sus mecánicas de juego a un poquito más que el mero hecho de cuidar y recolectar recursos.
Uno de los puntos destacables del juego está en el diseño de personajes y monstruos únicos, que han sido creados por Hiro Mashima, artista de sobra conocido por su trabajo en diferentes manga y colaboraciones, especialmente como responsable de Fairy Tail.