Tras los acontecimientos de
Bravely Default, 6 meses después de la batalla final,
Tiz Arrior libera al Celestial que estaba llevando, y su cuerpo se colapsa. Algún tiempo después,
Tiz se despierta en un tanque de restauración de
Magia Blanca, con síntomas de
disritmia cerebral. De pronto, una joven aparece y deja K.O. a guardias, científicos y doctores, utilizando además la técnica
Bravely Second para acabar con un poderoso monstruo. Libera a Tiz y se presenta como
Magnolia Arch, protagonista y heroína de esta secuela.
Por su parte,
Agnes Oblige se ha convertido en la nueva
Papa , y trabaja para traer la paz, firmando un importnate tratado. Sin embargo, el personaje es secuestrado por el emperador
Oblivion, y sus 3 mosqueteros -
Yu Zeneolsia, Jean Engarde, and Nikolai Nikolanikov /i> - parten a su rescate. Edea se unirá posteriormente a esta misión.